En el caso de acceso a la aplicación vía internet, podemos decir que la única desventaja es la dependecia a una conexión a Internet.

Esto puede significar una barrera a su adopción (a criterio de algunos). Si bien las empresas de telecomunicaciones cada vez son más fiables y mantienen mejores conexiones, siempre existe la posibilidad de quedarse sin conexión en la mitad de una jornada laboral. No obstante, este problema debe convertirse tan residual como la caída de la energía eléctrica, que si bien ocurre, no es causa suficiente como para no operar en base a ella.

Las ventajes de este tipo de aplicación son tan amplias, en relación a las aplicaciones tradicionales de escritoria, que sobrepasan en creces a sus desventajas posibles.